Свое творчество он посвятил промышленной и сельскохозяйственной тематике, отражая трудовые будни страны, происходящие изменения в сельской жизни. В картинах «Промышленный Ош» (1966), «Ош строится» (1972), «Хайдарканский комбинат» (1974) рисовал художественные образы рабочих крупных предприятий юга, их самотверженный труд, создал незабываемую галерею образов кыргызских рабочих. Жанрово-портретное произведение «Тогуз коргоол» (1974) считается большим творческим достижением Баатыра Жалиева.
Художественные произведения Баатыра Жалиева выставлялись на республиканских, всесоюзных и международных выставках, удостаиваясь призовых мест. Произведения художника хранятся в золотых фондах Кыргызского национального музея изобразительных искусств имени Гапара Айтиева и музеев стран СНГ.
Баатыр Жалиев в жанре графики создал лучшие циклы своих работ.
Им создана художественная форма и течение «Сизизм». Работы Баатыра Жалиева в настоящее время хранятся в доме-музее, созданном по собственной инициативе в 2012 году.
Художественный талант Баатыра Жалиева отмечен медалью «За трудовую доблесть», Почетными грамотами Верховного Совета Киргизской ССР. Ему присвоили звание «Народный художник Кыргызской Республики».
Президент Сооронбай Жээнбеков выразил соболезнования родным и близким талантливого художника, одного из классиков кыргызского изобразительного искусства Баатыра Жалиева